一般
海洋生物資源科学部門・海洋生物学分野・動物生態学研究室の紹介です
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統計解析のフリーソフトRを使った統計解析入門です。このコースはまだ執筆中ですが、ご覧になりたい方はどうぞ。
データの種類
データの種類分け
データの種類分けの間違い(生物学版)
記述統計とは
「平均像」は、必ずしも平均では分からない
図示の重要性
Rのサンプルデータセット
アヤメ (iris) という花のデータ
歯の成長データ
データの全体的な特徴を知りたい:代表値
データの全体的な特徴を知りたい:変数間の関係
データの変数名が知りたい
データの頭出しをしたい。
ヒストグラム
軸の指定
文字、数値の大きさ
X軸の間隔
色の指定
円グラフ
色の指定
箱ひげ図
軸の指定
文字、数値の大きさ
色の指定
データセット一覧の作図
散布図
軸の設定
点の形
点の色
複数の形、色の点を描く
pointsの例
凡例の表示
回帰直線を引く
ablineの他の例
文字と線の描画
曲線を描く
棒を横に並べる
凡例の表示や色の指定
はじめに
1種類の質的データ
1種類の量的データ
ベルヌーイ分布とは
「独立」とは
ベルヌーイ分布の最尤推定
最尤推定による母集団推定の結論
二項分布 (binomial distibution) とは
Rで二項分布を扱う
ある値となる確率
ある値以下 (よりも大きな値) となる確率
二項分布の作図
二項分布からのランダムなサンプリング
二項分布の最尤推定
離散型一様分布
離散型一様分布の確率関数
離散型一様分布からランダムなデータを得る
離散型一様分布のヒストグラム
連続型一様分布
連続型一様分布の確率密度関数
確率と確率密度
連続型一様分布からランダムなデータを得る
連続型一様分布の作図
連続型一様分布の最尤推定
χ2分布(カイ2乗分布)
χ2分布関連の呪文
χ2分布の確率密度
χ2分布の確率
χ2分布の形
χ2分布を自作してみる
χ2検定
1群のχ2検定
正規分布 (normal distribution) とは
正規分布の確率密度関数
標準正規分布 (Z)
Rで正規分布を扱う
正規分布の確率密度
正規分布における確率
正規分布の作図
正規分布からのランダムなサンプリング
正規分布が想定できるデータ
パソコンがなかった時代
t分布
t分布の確率密度関数
t分布の確率密度をRで求める
t分布の全体像をR で描く
あるt値以上、以下の確率をRで求める
F検定
Bartlett検定
2群の平均を比較する
対応2群のt検定
Studentのt検定(等分散が前提)
Welchのt検定(等分散を前提としない)
3群以上の平均の検定
Fisherの分散分析(等分散を前提)
Welchの分散分析(等分散を前提としない)
多重比較
Tukeyの方法(等分散を前提)
Games-Howellの方法(等分散を前提としない)
2群の順位を比較する
Wilcoxon検定
Mann-WhitneyのU検定
3群以上の順位を比較する
Kruskal-Wallis検定
相関係数
相関の検定
主軸分析
Kendallの順位相関