一般
海洋生物資源科学部門・海洋生物学分野・動物生態学研究室の紹介です
トピックアウトライン
統計解析とは
統計解析のフリーソフトRを使った統計解析入門です。このコースはまだ執筆中ですが、ご覧になりたい方はどうぞ。
データの種類
データの種類分け
データの種類分けの間違い（生物学版）- ダメな統計学 ファイル 1.4MB PDF document アップロード 20年 12月 4日 19:15
- 統計解析入門1-1 ファイル 1.4MB PDF document アップロード 20年 12月 27日 18:12
記述統計とは
「平均像」は、必ずしも平均では分からない
図示の重要性
データの読み込み
Rのサンプルデータセット
アヤメ (iris) という花のデータ
歯の成長データデータの全体的な特徴を知りたい：代表値
データの全体的な特徴を知りたい：変数間の関係
データの変数名が知りたい
データの頭出しをしたい。
作図
ヒストグラム
軸の指定
文字、数値の大きさ
X軸の間隔
色の指定円グラフ
色の指定箱ひげ図
軸の指定
文字、数値の大きさ
色の指定データセット一覧の作図
散布図
軸の設定
点の形
点の色
複数の形、色の点を描く
pointsの例
凡例の表示
回帰直線を引く
ablineの他の例文字と線の描画
曲線を描く棒を横に並べる
凡例の表示や色の指定
１変数のデータ解析
はじめに
１種類の質的データ
１種類の量的データベルヌーイ分布とは
「独立」とは
ベルヌーイ分布の最尤推定
最尤推定による母集団推定の結論二項分布 (binomial distibution) とは
Rで二項分布を扱う
ある値となる確率
ある値以下 (よりも大きな値) となる確率
二項分布の作図
二項分布からのランダムなサンプリング
二項分布の最尤推定離散型一様分布
離散型一様分布の確率関数
離散型一様分布からランダムなデータを得る
離散型一様分布のヒストグラム
連続型一様分布
連続型一様分布の確率密度関数
確率と確率密度
連続型一様分布からランダムなデータを得る
連続型一様分布の作図
連続型一様分布の最尤推定χ2分布（カイ２乗分布）
χ2分布関連の呪文
χ2分布の確率密度
χ2分布の確率
χ2分布の形
χ2分布を自作してみるχ2検定
1群のχ2検定正規分布 (normal distribution) とは
正規分布の確率密度関数
標準正規分布 (Z)
Rで正規分布を扱う
正規分布の確率密度
正規分布における確率
正規分布の作図
正規分布からのランダムなサンプリング
正規分布が想定できるデータ
パソコンがなかった時代ｔ分布
ｔ分布の確率密度関数
ｔ分布の確率密度をRで求める
ｔ分布の全体像をR で描く
あるｔ値以上、以下の確率をRで求める
２変数のデータ解析
F検定
Bartlett検定２群の平均を比較する
対応２群のｔ検定
Studentのｔ検定（等分散が前提）
Welchのｔ検定（等分散を前提としない）３群以上の平均の検定
Fisherの分散分析（等分散を前提）
Welchの分散分析（等分散を前提としない）多重比較
Tukeyの方法（等分散を前提）
Games-Howellの方法（等分散を前提としない）２群の順位を比較する
Wilcoxon検定
Mann-WhitneyのU検定３群以上の順位を比較する
Kruskal-Wallis検定相関係数
相関の検定
主軸分析
Kendallの順位相関
