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    • 環境DNAを用いたもうひとつの手法は、種特異的なプライマーを使ってある特定の生物のDNAを増幅し、定量PCRによってDNA量（濃度）を推定する方法です。水中の生物を捕獲することなく、採水するだけでバイオマスや個体数を推定することができれば素晴らしいことです。しかし、実際の海では流れが一定でなく、生物から放出されたDNAが流れに乗って広範囲に輸送・拡散されていくでしょう。またその過程で微生物による分解などの影響を受けて、DNAの濃度は減衰していきます。そこで私たちは、まず内湾域の詳細な物理環境を再現できる数値モデルを開発しました。そしてそのモデルを舞鶴湾に適用し、魚群探知機によって得られたマアジの生息数や湾内の分布をもとに海水中にDNAを放出し、DNAがどのように輸送されながら減衰していくかをシミュレーションしました。その結果、観測された環境DNAの濃度分布を再現することに成功しました。

      海洋のような開放系でも、魚の分布を反映して環境DNAの分布や濃度が決まっているならば、環境DNAを利用してバイオマスを推定できる可能性があります。そこで対象海域を細かなグリッドに区切り、モデルを使ってそのひとつひとつからDNAを放出してすべてのグリッドにどれくらいの量のDNAが到達するかを計算しておきます。そして、それらをどう組み合わせたら現実の環境DNA濃度の分布と最もよく合うかを統計的に計算することによって、グリッドごとの魚の個体数密度を推定しました。その結果、魚群探知機による推定と同程度のバイオマスを得ることができました。


    • 笠井亮秀（2020）JATAFFジャーナル URL

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    • 環境DNAの採水および濾過方法 Environmental DNA sampling and filtration methods Página