赤潮・アオコの原因藻類を殺滅できたとしても、他の水棲生物へ甚大な影響がでるようであれば困ります。同定した殺藻物質の他の生物への影響も検討します。遊泳能力のある魚類などは逃げる事ができますが、赤潮・アオコ原因藻類と同じ光合成生物で逃げる事が出来ない植物などへの影響は注意深く調べる必要があります。