トピックアウトライン

  • 外洋の環境DNA

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    • 教育プログラム企画推進室・バランスドオーシャン運用部・安です

    • ※安先生は2023年3月に北海道大学を退職されました。


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  • 環境DNAの研究

    • 環境DNAは環境中に存在する生物由来のDNAのことです。

      環境DNA法は生き物を直接傷つけず、土や水などを採集することで生物調査ができる利点を持ち、注目されています。

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      環境DNAの詳細についてはこちら URL

  • 外洋の環境DNA

  • 船上での採水および濾過

    • 船上で大量の水を採水する方法は二つあります。

      1 採水器を利用する方法：特定の深度の採水ができます。

      　　　　　　　　　　　　またCTDを採水器と一緒に沈めることで環境データの収集が同時にできます。


      2 研究用海水を採る：船内の蛇口から、船のポンプで汲み取っている表層水が出ます。

      　　　　　　　　　（出ない船もあるのでご注意！）

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      採水器についてはこちら ページ

    • 採水した水は船上で速やかに濾過、あるいはBAC（塩化ベンザルコニウム）を入れて研究室に持ち帰ります。



  • 外洋の環境DNA検出率向上実験

    • 上の動画で紹介した方法で外洋（恵山沖）の表層水を採水し、10Lのタンクに均等に入るようにしました。

      そして以下の6つの実験区を設けて、環境DNA検出率向上実験を行いました。


    • 本研究では、外洋の水が河川・沿岸と違って浮遊物などが少なく、水中の環境DNAがフィルターを通過してしまう可能性に着目し、DNAが吸着してフィルターに残るよう人為的に添加物を入れました。

      添加物は、自然界で一般的にみられる砂、吸水力があると知られている珪藻土、既に環境DNAの検出率向上実験で使われたジルコニアビーズ、そしてガスクロマトグラフィーに使われているモレキュラーシーブを用いました。また、0.22 um pore sizeのフィルターを用意し、0.45 umのフィルターと比較しました。

      全ての実験区は2Lを濾過したフィルター X 5反復で実施しました。


    • 実験は夏と冬に2回実施し、季節により異なる結果となりました。

      夏は珪藻土を添加したExp4、冬はジルコニアビーズを添加したExp5で最も多い種数が検出されました。


    • 夏と冬のデータをあわせて一般化線形モデルで解析した結果、添加物はいずれも種数に有意な影響を及ぼしました。

      一方で、0.22umのフィルターは 0.45umのフィルターに比べて有意な差が認められませんでした。


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      夏と冬で検出された魚類群集についてはこちら URL

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  • 【関連するまとめコース】