セクション: （27）タンパク質の同定（NCBIデータベースでの検索） | 水圏生化学実験（タンパク質）【実験動画】

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- 活動水圏生化学実験（タンパク質）（27）タンパク質の同定（NCBIデータベースでの検索） ... を選択する
  
  用語集
  BLAST（ブラスト）：Basic Local Alignment Search Tool、相同性検索を行うプログラム
  NCBIデータベース（エヌシービーアイでーたべーす）：National Center for Biotechnology Information、米国国立バイオテクノロジー情報センターが運用するデータベース
  
  字幕
  1
  00:00:05,605 --> 00:00:10,744
  NCBI database というのは
  BLAST ではありません
  
  2
  00:00:10,744 --> 00:00:14,481
  (Mascot server) で取得した
  アクセッションIDを使います
  
  3
  00:00:14,481 --> 00:00:21,788
  上の方のAll Databases と
  書いてあるところを Proteinにします
  
  4
  00:00:21,788 --> 00:00:28,128
  そしてアクセッションIDを入力します
  
  5
  00:00:28,128 --> 00:00:30,697
  Search をクリックすると
  
  6
  00:00:30,697 --> 00:00:36,936
  そのアクセッションIDに登録されている
  中身の詳細が表示されます
  
  7
  00:00:38,304 --> 00:00:44,110
  下の方にアミノ酸配列も
  一文字略号で示されています
  
  8
  00:00:44,110 --> 00:00:47,714
  そのタンパク質についての
  詳細な情報です
  
  9
  00:00:47,714 --> 00:00:52,519
  何という生き物から
  得られたのかなどが書かれています
  
  10
  00:00:52,519 --> 00:00:59,959
  例えば　この例だったら
  organism のところに
  
  11
  00:00:59,959 --> 00:01:03,229
  どういう生物なのか
  学名が書いてあります
  
  12
  00:01:03,229 --> 00:01:04,931
  Cyprinus carpio
  
  13
  00:01:04,931 --> 00:01:06,966
  これはコイの学名になります
  
  14
  00:01:06,966 --> 00:01:09,636
  それから female なので
  メスです
  
  15
  00:01:09,636 --> 00:01:18,211
  メスの個体から得られた
  アミノ酸配列を示しています
  
  16
  00:01:18,278 --> 00:01:21,348
  材料は何かというと
  blood 血です
  
  17
  00:01:21,348 --> 00:01:23,683
  血からこの配列を得ました
  
  18
  00:01:23,683 --> 00:01:28,288
  それから developmental stage は
  Adult 成体から得たものです
  
  19
  00:01:28,288 --> 00:01:33,760
  それから誰がこのデータを
  登録したのかという人の名前です
  
  20
  00:01:33,760 --> 00:01:38,965
  どういう論文に載っているのか
  という情報がここに載っています
  
  21
  00:01:38,965 --> 00:01:46,306
  ここにタンパク質の名前が
  書いてある場合もあります
  
  22
  00:01:46,306 --> 00:01:51,745
  (表にタンパク質名などの
  情報を記入していきます)
  
  23
  00:01:51,745 --> 00:01:56,750
  (完成した表)