セクションアウトライン


    • 用語集 Centroid Mass(セントロイドマス)
      S/N Ratio(エスエヌレシオ):SN比、信号と雑音の比
      アクトミオシン:アクチンとミオシンの結合体
      筋形質画分(きんけいしつかくぶん):筋繊維の細胞質の一部の成分を取り分けたもの

      字幕 1
      00:00:05,605 --> 00:00:08,508
      バンドのタンパク質の
      同定ということで

      2
      00:00:08,508 --> 00:00:10,810
      ゲル内消化した

      3
      00:00:10,810 --> 00:00:13,980
      バンドのタンパク質の質量分析を行い

      4
      00:00:13,980 --> 00:00:17,217
      質量スペクトルをとりました

      5
      00:00:17,217 --> 00:00:22,489
      今日は このデータに基づいて

      6
      00:00:22,489 --> 00:00:24,424
      ネット検索をして

      7
      00:00:24,424 --> 00:00:27,594
      そのタンパク質が
      何なのかを決定します

      8
      00:00:27,594 --> 00:00:32,565
      正面のスクリーンに出ているのは

      9
      00:00:32,565 --> 00:00:33,500
      アクトミオシンについては

      10
      00:00:33,500 --> 00:00:39,539
      AM1からAM9の 9つのタンパク質

      11
      00:00:39,539 --> 00:00:41,408
      筋形質画分タンパク質は

      12
      00:00:41,408 --> 00:00:46,813
      SP1からSP12の 12種のバンドです

      13
      00:00:46,813 --> 00:00:52,452
      青い文字は担当した班です

      14
      00:00:52,452 --> 00:00:59,592
      これに 皆さんのタンパク質同定結果を
      書き込んでもらって

      15
      00:00:59,592 --> 00:01:01,961
      表を完成させます

      16
      00:01:01,961 --> 00:01:06,232
      筋形質画分の11番は
      今年のデータがありません

      17
      00:01:06,232 --> 00:01:13,640
      実は 去年のデータがあるので

      18
      00:01:13,640 --> 00:01:19,713
      それを使って 今日の作業を説明します

      19
      00:01:19,713 --> 00:01:30,657
      スペクトルの下のピークリストから
      データをエクセルに貼り付けます

      20
      00:01:30,657 --> 00:01:33,293
      機械的に分子量1000以下の行を削除します

      21
      00:01:33,293 --> 00:01:37,697
      エクセルシート 1行目は項目行

      22
      00:01:37,697 --> 00:01:39,866
      ここは選択せずに
      その下の行(2行目)からです

      23
      00:01:39,866 --> 00:01:43,436
      A列はIndexで番号がついています
      そのすぐ右側の

      24
      00:01:43,436 --> 00:01:48,274
      B列が分子量で 506など
      値が入っています

      25
      00:01:48,274 --> 00:01:49,309
      2行目以下を選択します

      26
      00:01:49,309 --> 00:01:52,979
      1000以下の行を全て選択します

      27
      00:01:52,979 --> 00:01:58,618
      右クリックから 削除します

      28
      00:01:58,618 --> 00:02:05,759
      次に シートの左上をクリックして
      シート全体を選択します

      29
      00:02:05,759 --> 00:02:14,701
      この状態で ホームタブの「並べ替えとフィルター」と
      「ユーザー設定の並べ替え」をクリックします

      30
      00:02:14,701 --> 00:02:21,608
      表示されたダイアログ内の左側
      「最優先されるキー」をクリックします

      31
      00:02:21,608 --> 00:02:26,846
      1行目の項目行の
      項目が選択できます

      32
      00:02:26,846 --> 00:02:30,83
      項目から 「S/N Ratio」 を選択します

      33
      00:02:30,83 --> 00:02:34,320
      SはSignal NはNoise

      34
      00:02:34,320 --> 00:02:37,390
      ノイズに対する シグナルの比
      ということです

      35
      00:02:37,390 --> 00:02:46,66
      ノイズに対してピークのシグナルがどれくらい
      はっきりしているかを表す数値です

      36
      00:02:46,66 --> 00:02:54,140
      次に 右端の「順序」を
      「降順(大きい順)」にします

      37
      00:02:54,140 --> 00:02:56,142
      「OK」をクリック

      38
      00:02:56,142 --> 00:03:03,49
      S/N Ratio の大きい順に
      並べ替えられます

      39
      00:03:03,49 --> 00:03:07,153
      1番大きいのは1943で
      段々小さくなっていきます

      40
      00:03:07,153 --> 00:03:12,492
      次に 「Centroid Mass」の列

      41
      00:03:12,492 --> 00:03:17,864
      その列だけを選択

      42
      00:03:17,864 --> 00:03:23,403
      S/N Ratio が
      20以上のものだけ選択します

      43
      00:03:23,403 --> 00:03:32,45
      そしてこれをコピーします