用語集
Centroid Mass(セントロイドマス)
S/N Ratio(エスエヌレシオ):SN比、信号と雑音の比
アクトミオシン:アクチンとミオシンの結合体
筋形質画分(きんけいしつかくぶん):筋繊維の細胞質の一部の成分を取り分けたもの
字幕
1
00:00:05,605 --> 00:00:08,508
バンドのタンパク質の
同定ということで
2
00:00:08,508 --> 00:00:10,810
ゲル内消化した
3
00:00:10,810 --> 00:00:13,980
バンドのタンパク質の質量分析を行い
4
00:00:13,980 --> 00:00:17,217
質量スペクトルをとりました
5
00:00:17,217 --> 00:00:22,489
今日は このデータに基づいて
6
00:00:22,489 --> 00:00:24,424
ネット検索をして
7
00:00:24,424 --> 00:00:27,594
そのタンパク質が
何なのかを決定します
8
00:00:27,594 --> 00:00:32,565
正面のスクリーンに出ているのは
9
00:00:32,565 --> 00:00:33,500
アクトミオシンについては
10
00:00:33,500 --> 00:00:39,539
AM1からAM9の 9つのタンパク質
11
00:00:39,539 --> 00:00:41,408
筋形質画分タンパク質は
12
00:00:41,408 --> 00:00:46,813
SP1からSP12の 12種のバンドです
13
00:00:46,813 --> 00:00:52,452
青い文字は担当した班です
14
00:00:52,452 --> 00:00:59,592
これに 皆さんのタンパク質同定結果を
書き込んでもらって
15
00:00:59,592 --> 00:01:01,961
表を完成させます
16
00:01:01,961 --> 00:01:06,232
筋形質画分の11番は
今年のデータがありません
17
00:01:06,232 --> 00:01:13,640
実は 去年のデータがあるので
18
00:01:13,640 --> 00:01:19,713
それを使って 今日の作業を説明します
19
00:01:19,713 --> 00:01:30,657
スペクトルの下のピークリストから
データをエクセルに貼り付けます
20
00:01:30,657 --> 00:01:33,293
機械的に分子量1000以下の行を削除します
21
00:01:33,293 --> 00:01:37,697
エクセルシート 1行目は項目行
22
00:01:37,697 --> 00:01:39,866
ここは選択せずに
その下の行(2行目)からです
23
00:01:39,866 --> 00:01:43,436
A列はIndexで番号がついています
そのすぐ右側の
24
00:01:43,436 --> 00:01:48,274
B列が分子量で 506など
値が入っています
25
00:01:48,274 --> 00:01:49,309
2行目以下を選択します
26
00:01:49,309 --> 00:01:52,979
1000以下の行を全て選択します
27
00:01:52,979 --> 00:01:58,618
右クリックから 削除します
28
00:01:58,618 --> 00:02:05,759
次に シートの左上をクリックして
シート全体を選択します
29
00:02:05,759 --> 00:02:14,701
この状態で ホームタブの「並べ替えとフィルター」と
「ユーザー設定の並べ替え」をクリックします
30
00:02:14,701 --> 00:02:21,608
表示されたダイアログ内の左側
「最優先されるキー」をクリックします
31
00:02:21,608 --> 00:02:26,846
1行目の項目行の
項目が選択できます
32
00:02:26,846 --> 00:02:30,83
項目から 「S/N Ratio」 を選択します
33
00:02:30,83 --> 00:02:34,320
SはSignal NはNoise
34
00:02:34,320 --> 00:02:37,390
ノイズに対する シグナルの比
ということです
35
00:02:37,390 --> 00:02:46,66
ノイズに対してピークのシグナルがどれくらい
はっきりしているかを表す数値です
36
00:02:46,66 --> 00:02:54,140
次に 右端の「順序」を
「降順(大きい順)」にします
37
00:02:54,140 --> 00:02:56,142
「OK」をクリック
38
00:02:56,142 --> 00:03:03,49
S/N Ratio の大きい順に
並べ替えられます
39
00:03:03,49 --> 00:03:07,153
1番大きいのは1943で
段々小さくなっていきます
40
00:03:07,153 --> 00:03:12,492
次に 「Centroid Mass」の列
41
00:03:12,492 --> 00:03:17,864
その列だけを選択
42
00:03:17,864 --> 00:03:23,403
S/N Ratio が
20以上のものだけ選択します
43
00:03:23,403 --> 00:03:32,45
そしてこれをコピーします