用語集
PMF（ピーエムエフ）：ペプチドマスフィンガープリンティング
アイソトープ：同位体
同位体（どういたい）：原子番号が同じで、中性子数の異なる核種を互いに同位体という
ヒストグラム：縦軸に度数、横軸に階級をとるグラフ
モノアイソトピックマス：モノアイソトピック質量、単一の同位体から成る分子の質量
字幕
1
00:00:05,605 --> 00:00:10,577
タンパク質の同定に使う
分子量の値としては
2
00:00:10,577 --> 00:00:14,914
集まっているピークの中の
一番分子量の小さなもの
3
00:00:14,914 --> 00:00:17,17
一番左側のものを使います
4
00:00:17,17 --> 00:00:25,658
それは モノアイソトピックマス
といいます
5
00:00:25,658 --> 00:00:30,830
アイソトピックとは何かというと
アイソトープは同位体のことです
6
00:00:30,830 --> 00:00:36,770
ピークが複数に
1ずつずれて出てくるのは
7
00:00:36,770 --> 00:00:45,11
自然界に存在する
炭素原子の同位体と関係があります
8
00:00:45,11 --> 00:00:52,419
自然界に存在する炭素の
大部分 99% がC12です
9
00:00:52,419 --> 00:00:58,792
陽子と中性子の数が6個ずつの
C12が99％ です
10
00:00:58,792 --> 00:01:07,934
しかし 陽子の数が6個 中性子の数が7個の
原子核をもった C13というのが1% 存在します
11
00:01:07,934 --> 00:01:12,706
C14というのは 放射性で
もっと割合は少ないです
12
00:01:12,706 --> 00:01:18,144
天然の炭素原子には
このように (3種類の同位体が)含まれます
13
00:01:18,144 --> 00:01:24,584
(炭素原子)で 生物の体も
タンパク質も ペプチドもできているので
14
00:01:24,584 --> 00:01:28,154
ペプチドの中にも
15
00:01:28,154 --> 00:01:36,96
炭素の原子が100個あれば
そのうち 1個はC12ではなく C13でしょう
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00:01:36,96 --> 00:01:40,900
およそそれくらいの割合で
C13が含まれています
17
00:01:40,900 --> 00:01:48,141
モノアイソトピックマスのピークを
与えたペプチドは
18
00:01:48,141 --> 00:01:52,178
全ての炭素原子が
C12でできています
19
00:01:52,178 --> 00:01:58,585
ペプチドはアミノ酸が
5個とか10個とか20個 つながったものです
20
00:01:58,585 --> 00:02:05,458
炭素原子はその中に
10個 20個どころか 100個とかたくさんあります
21
00:02:05,458 --> 00:02:12,265
それが全部C12の場合は
モノアイソトピックマスを示します
22
00:02:12,265 --> 00:02:17,904
1個だけ C13が入っているという分子も
ある程度 あります
23
00:02:17,904 --> 00:02:21,808
それが (分子量が)1大きいところに
(ピークが) 出る理由です
24
00:02:21,808 --> 00:02:32,185
2個 C13が入っているという分子もあって
もう1つ大きいところに(ピークが)出ます
25
00:02:32,185 --> 00:02:35,522
その図にあるように
26
00:02:35,522 --> 00:02:44,97
分子量が600 当たりで一番高いピークは
モノアイソトピックマスです
27
00:02:44,97 --> 00:02:49,135
分子量が1800 くらいの
左から3番目のピークは
28
00:02:49,135 --> 00:02:57,344
モノアイソトピックマス(のピーク)と
1個だけC13が入っているピークは
29
00:02:57,344 --> 00:03:00,46
だいたい高さが同じになります
30
00:03:00,46 --> 00:03:07,420
ペプチドの分子量が大きくなると
炭素原子の数も多くなるからです
31
00:03:07,420 --> 00:03:12,959
そこにC13が1個入っている
という確率がだんだん高くなる
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00:03:12,959 --> 00:03:19,566
さらに分子量が大きくなると
モノアイソトピックマスを示すものは ピークが低くなって
33
00:03:19,966 --> 00:03:27,907
C13が1個入っているもの 2個入っているものの方が
量が多くなります
34
00:03:27,907 --> 00:03:31,878
どの場合でも
PMFでタンパク質の同定をするときに
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00:03:31,878 --> 00:03:37,384
重要なのは
モノアイソトピックマスの値です
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00:03:37,384 --> 00:03:42,789
質量分析計は
分子量1の違いも測定できる
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00:03:42,789 --> 00:03:50,797
1の誤差もないからこそ
タンパク質の同定ができます
38
00:03:50,797 --> 00:03:57,771
それを意識しながら
解析を行う必要があります
39
00:03:57,771 --> 00:04:03,9
モノアイソトピックマスの
ピークのリストを作ってもらいます
40
00:04:03,9 --> 00:04:08,348
最終的にピークのリストを
エクセルシートの形で保存します
41
00:04:08,348 --> 00:04:10,316
そのデータを使って
42
00:04:10,316 --> 00:04:15,355
PMF解析による
タンパク質の同定を(行います)
43
00:04:15,355 --> 00:04:17,257
最終的に
44
00:04:17,257 --> 00:04:23,96
電気泳動でも行った
どのバンドがどういう結果になりましたという
45
00:04:23,96 --> 00:04:25,231
一覧が完成します
